При выходе участника из ООО полученная им действительная стоимость доли подлежит обложению НДФЛ.

Абзацем вторым подпункта 2 пункта 2 статьи 220 НК предусмотрено, что при продаже доли (её части) в уставном капитале общества, при выходе из состава участников общества (и в некоторых других случаях) налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведённых им и документально подтверждённых расходов, связанных с приобретением этого имущества (имущественных прав).

Поэтому сумма дохода, подученного при выходе из состава участников ООО, может быть уменьшена на соответствующие документально подтверждённые расходы на приобретение доли.

Источник: Audit-it.ru