В письме от 12.07.17 № 03-04-05/44417 Минфин указал, что перевод работников из одного филиала в другой производится по общим правилам, предусмотренным статьей 72 Трудового кодекса для перевода работника из одного структурного подразделения в другое.

Абзацем вторым пункта 7 статьи 226 НК установлено, что налоговые агенты — российские организации, имеющие обособленные подразделения, обязаны перечислять исчисленные и удержанные суммы налога в бюджет как по месту своего нахождения, так и по месту нахождения каждого своего обособленного подразделения.

Сумма налога, подлежащая уплате в бюджет по месту нахождения подразделения, определяется исходя из суммы дохода, подлежащего налогообложению, начисляемого и выплачиваемого работникам этого подразделения.

Если работник одного филиала, в соответствии с правилами, предусмотренными статьей 72 ТК, переводится на работу в другой филиал (где в соответствии с допсоглашением к трудовому договору будет находиться его рабочее место), состоящий на учете в налоговом органе по месту своего нахождения, то сумма НДФЛ, исчисленного и удержанного с доходов такого работника, в другом филиале должна быть перечислена в бюджет по месту учета другого филиала.

Источник: Audit-it.ru